胰腺炎是胰腺因胰蛋白酶的自身消化作用而引起的疾病，胰腺有水肿、充血、出血及坏死等骨髓间质干细胞在治疗胰腺炎尤其是重症胰腺炎及控制其并发症方面有显著疗效。
1、骨髓间质干细胞通过抑制炎症因子释放治疗慢性胰腺炎
慢性胰腺炎是以胰腺慢性炎症损伤及纤维化为主要病理特征的慢性进展性疾病，骨髓间质干细胞可能具有潜在治疗价值，但目前研究尚不多见。通过观察骨髓间质干细胞对慢性胰腺炎炎症因子水平的影响，发现同种异体骨髓间质干细胞移植可降低促炎症因子水平，提高抗炎因子浓度，有助于减轻慢性胰腺炎的炎症反应，减缓甚至阻止其发展。过研究发现，骨髓间质干细胞对慢性胰腺炎的胰腺损伤有显著修复作用，除抑制炎症因子释放外，其机制可能和抑制结缔组织生长因子、转化生长因子-β产生、抑制炎症反应、减少胶原增生有关。
2、骨髓间质干细胞治疗重症急性胰腺炎
急性胰腺炎是多种病因导致胰酶在胰腺内被激活后引起胰腺组织自身消化、水肿、出血甚至坏死的炎症反应。研究结果已得出骨髓间质干细胞移植对重症急性姨腺炎急性炎症反应的修复机制，移植的骨髓间质干细胞不但能改善预后，而且在治疗重症急性胰腺炎的同时还具有归巢、迁移以及种植能力。通过观察到患重症急性胰腺炎移植骨髓间质干细胞后血清淀粉酶和脂肪酶水平降低，腺泡细胞坏死、胰腺水肿和炎症浸润得到改善。此项研究证明骨髓间质干细胞作为治疗重症急性胰腺炎的有效药物，能有效减
轻胰腺炎的损伤。
3、骨髓间质干细胞治疗胰腺炎并发症
重症急性胰腺炎常导致严重的全身并发症，尤其是既往共存疾病的恶化，如冠心病和肺部疾病的发生。骨髓间质干细胞在治疗重症急性胰腺炎全身并发症尤其是肺部并发症方面存在极大潜力。通过实验证明，骨髓间质干细胞可通过修复胰腺和肺组织及减轻炎症反应来治疗损伤。
