外周血干细胞采集的时候，血液检查、心电图、X 光等检查也是必要的。但是，一般不会采取自己的血液。因为外周血干细胞一般的状态下不能采集，需要皮下注射粒细胞集落刺激因子5-6 天时间。这个药物有增加白血球的作用，被广泛应用于血液疾病的治疗。外周血干细胞采集的时候，给正常的人注射此药物，会使白细胞增加到正常状态的 4-5 倍。因此，腰部等的骨头容易出现疼痛，另外，少数会出现脾脏破裂的重大并发症，必须住院进行观察。另外，将来会有未知并发症发生。
实际外周血干细胞的采集，是在皮下注射粒细胞集落刺激因子投入后的第 4 天以及第 5 天进行。采取和血液中心的成分采血操作方式一样，在两处进行点滴。另外，没有粗的血管的情况下用单侧的动脉血管进行。
采取单侧的血液，通过机器处理去除必须成分以后从单侧将血液返回体内。这是同时进行的。采取的时候为了防止血液凝固会在血液中混入抗凝固剂，血液中的钙会减少会引起嘴唇麻木、手指麻木等症状，感觉到异常情况时请尽早提出。处理血液量是患者体重每公斤 150-200ml，实际采取保存量只有 50-60ml。对皮下注射粒细胞集落刺激因子的反应性个体差异性非常明显，采取的外周血干细胞也有个体差异，采取量少的情况下也会请求追加采集。
