祝谌予重视辨证辨病相结合。诊治糖尿病时既运用望、闻、问、切中医宏观辨证方法，又参考血糖、尿糖、酮体、血脂等微观检测指标。祝谌予认为糖尿病不仅有阴虚燥热病机，且随病程进展常可出现气阴两虚、脾肾亏损，气阴两虚常致血瘀为患，加重糖尿病病情而致多种并发症。因此，临证不独执滋阴清热一法，而且重视益气养阴、培补脾肾、活血化瘀之法，开创了活血化瘀法治疗糖尿病的先河。祝谌予认为气阴两伤、血脉瘀滞常贯穿于糖尿病的始终，不仅创立了生津活血的药对“葛根配丹参”，且师承施今墨苍术配玄参，自拟降糖对药方（药物组成：黄芪３０ｇ，生地黄３０ｇ，苍术１５ｇ，玄参３０ｇ，丹参３０ｇ，葛根１５ｇ）益气养阴，活血化瘀，作为降糖基本方，加减化裁治疗糖尿病，如血糖不降加人参白虎汤；尿糖不降加天花粉、乌梅；尿酮体阳性加黄芩、黄连、茯苓；饥饿感明显加玉竹、熟地黄；心悸加石菖蒲、远志；皮肤瘙痒加蒺藜、地肤子；阳萎不举加二仙（仙茅、淫羊藿）、肉苁蓉，甚或蜈蚣２条。

 

祝谌予主张脏腑气血阴阳辨证，治疗糖尿病重视培补脾肾。临床将糖尿病分为５型：

气阴两虚型，治宜益气养阴，方用降糖对药方；

阴虚火旺型，治宜滋阴降火，方用一贯煎；

燥热入血型，治宜清热凉血兼益气养阴，方用温清饮加味（药物组成：黄芩、黄连、黄柏、栀子、川芎、当归、白芍、生地黄、黄芪、苍术、玄参）；

阴阳俱虚型，治宜温阳益阴，益气生津，方用桂附地黄汤加减；

瘀血阻络型，治宜活血化瘀，益气养阴，方用自拟降糖活血方【降糖对药方＋调气活血方（药物组成：广木香、益母草、当归、赤芍、川芎）】。

 

祝谌予认为糖尿病慢性并发症乃本虚标实之证，气阴两伤、脾肾阳虚、阴阳两虚为本，瘀血阻络、痰浊水湿等为标，常用降糖对药方加减治疗，如合并胸痹加冠心Ⅱ号方（药物组成：川芎、丹参、赤芍、红花、羌活）；合并中风辨证为气滞血瘀者加血府逐瘀汤，气虚血瘀者加补阳还五汤；合并糖尿病肾病出现蛋白尿者重用黄芪至５０ｇ，加山药、续断、益母草、白花蛇舌草；合并痹证（周围神经病变）加自拟四藤一仙汤（药物组成：鸡血藤、络石藤、海风藤、钩藤、威灵仙）。