骨髓干细胞除了被证实可以分化为肝实质细胞外，还发现
骨髓干细胞移植后，可以通过分泌基质金属蛋白酶-13和基质蛋白酶-9促进肝纤维化的逆转。在肝脏损伤时，主要通过肝源性干细胞增殖及分化修复肝组织。
2006年，被观察到骨髓干细胞移植对损伤肝脏的治疗作用，发现其可以改善大鼠的肝功能，抑制肝纤维化形成，同时证实肝细胞生长因子（HGF）在此治疗过程中发挥了重要作用。
使用慢性肝脏损伤小鼠模型研究发现卵圆细胞可分泌淋巴毒素β并作用于肝星状细胞（HSC）上的相应受体，通过分泌趋化因子间接抑制肝纤维化的进展，将骨髓干细胞移植到大鼠
肝硬化模型，研究发现骨髓干细胞可以定植于受体肝脏，且移植组肝组织内Ⅰ型胶原表达及羟脯氨酸的含量较未移植组明显下降，肝细胞生长因子升高，从而证实骨髓干细胞除了可以自身分化为肝细胞外，还具有抗纤维化的作用。
将骨髓干细胞移植应用于成人肝硬化患者，实验结果显示其可以改善患者的肝功能，抑制肝纤维化，患者治疗后肝功能、凝血机制及临床症状明显改善。
乙肝后肝硬化失代偿期患者的分组对照研究显示，自体骨髓干细胞移植在乙型肝炎肝硬化晚期的治疗受到了良好近期效果，未见明显副作用。远期192周观察显示，实验组肝硬化合并肝癌或死亡率明显低于对照组。
国内报道，对78例肝硬化患者行自体骨髓干细胞移植治疗，在移植4周后，患者丙氨酸转移酶（ALT）明显降低，白蛋白、PTA明显上升，Child-pugh评分显著提高。患者腹水明显减少或消失、乏力纳差等症状改善。
以上结果显示，骨髓干细胞移植治疗肝硬化能有效改善损伤肝的组织学，提高肝细胞白蛋白及肝细胞生长因子的合成、分泌能力，促进肝细胞损伤的修复，可以成为治疗肝硬化的一种新手段。
