目前临床应用的有同种异体
骨髓干细胞移植和自体
骨髓干细胞移植，但同种异体骨髓干细胞移植面临着缺乏供体细胞、移植细胞被排斥等问题，而自体骨髓干细胞移植则很好地解决了这些矛盾。
近年来国内外学者对自体骨髓干细胞移植治疗
肝硬化患者的安全性和有效性给予了高度关注，而且大多数报道对此持积极和肯定的态度。骨髓干细胞的移植途径很多，临床常见的有肝动脉移植、门静脉移植、脾组织内移植和腹腔内移植等。
1、肝动脉移植
肝动脉内血氧含量丰富，在肝内依次分为小叶间动脉和终末肝微动脉，最后通入肝血窦,有利于植入骨髓干细胞在肝内存活、增殖及分化。一般由股动脉介入插管途径将骨髓干细胞直接注入到肝脏。但肝动脉血流迅速，且从肝脏超微结构来看，似乎并不利于骨髓干细胞在肝窦内迁移与定居。而目前临床上最为常用，实践中效果较理想。
2、门静脉或肝组织内移植
门脉内含高浓度的嗜肝细胞因子和旁分泌生长因子，选择性血管内介入将骨髓干细胞直接注入门静脉，最大限度地使骨髓干细胞停留在肝脏，因此有作者认为门静脉移或肝内移植是骨髓干细胞移植的最佳途径，可为骨髓干细胞在体内诱导增殖提供充分保障。
3、脾内移植
脾内移植的肝细胞具有良好的生理功能和长期的存活率，实验观察发现：
(1)移植后的骨髓干细胞在脾脏的红髓增生成窦状进而形成肝细胞索；
(2)移植肝细胞保留有正常肝细胞的超微结构特征；
(3)移植肝细胞能分泌白蛋白，分解胆红素等。
因此，脾脏可能是肝细胞移植的理想部位。移植在脾脏的干细胞虽然能在短期内达到改善肝功能的目的，但由于其不能在脾脏内形成有效的肝小叶等排泌结构，其依赖于脾脏内骨髓干细胞的分化程度，短期效果主要取决于由脾脏回流到肝脏的骨髓干细胞数目及其分化增殖能力。而其远期临床疗效及安全性需进一步关注。
4、腹腔内移植
腹腔是骨髓干细胞移植最方便易行的治疗途径，由于腹腔血液与淋巴结丰富，营养物质和代谢产物交换面积大，要求其移植细胞的数量要有足够量，但腹腔内移植细菌感染的机会多，易致腹膜炎和肠粘连，因此临床上应用比较少。而近年来有研究者将脐血干细胞采用微囊技术封装后植入CCL4诱导的肝损伤鼠模型腹腔内，结果显示在体内细胞分化良好，受损肝功能得到了恢复。但由于骨髓干细胞在腹腔内多呈悬浮状态，无法直接进入肝脏，细胞难以长期存活，且骨髓干细胞血管化需要较长时间，限制了治疗效果，因此腹腔穿刺途径基本无临床应用前景。
